汉诺威96成立于1896年4月12日，初期只是地区联赛球会，经过与多间球会合并，于1935年正式参与国家级联赛。二次大战时曾一度被迫解散，直到1945年才重新组班。1963年德甲联赛成立，汉诺威96被编在乙组联赛作赛。
七十年代时这家球会曾受到财政问题困扰，一度在低组别联赛打滚。1990年汉诺威96又一次出现财困，幸而在1992年赢得了德国杯冠军，才止住了破产危机。这届德国杯汉诺威96先后对着多蒙特、波琴、卡尔斯鲁厄、云达不莱梅和慕逊加柏 ，乃首支德国低组别球会赢得这个杯赛冠军。
但汉诺威96一直要到十年后，2001/02赛季，球队才能升上甲组。
近季成绩
编辑
年度
级别
成绩
1999-2000年
德乙（II）
第 10 位
2000-01年
德乙
第 9 位
2001-02年
德乙
第 1 位（升级）
2002-03年
德甲（I）
第 11 位
2003-04年
德甲
第 14 位
2004-05年
德甲
第 10 位
2005-06年
德甲
第 12 位
2006-07年
德甲
第 11 位
2007-08年
德甲
第 8 位
2008-09年
德甲
第 11 位
2009-10年
德甲
第 15 位
2010-11年
德甲
第 4 位
2011-12年
德甲
第 7 位
2012-13年
德甲
第 9 位
2013-14年
德甲
第 10 位
2014-15年
德甲
第 13 位
2015-16年
德甲
第 18 位（降级）
2016-17年
德乙
第 2 位（升级）
2017-18年
德甲
第 13 位
2018-19年
德甲
第 17 位（降级）
2019-20年
德乙
第 6 位
2020-21年
德乙
第 13 位